威斯康星大学麦迪逊分校是美国顶级的公立研究型大学，位居公立常春藤之列，在世界范围内享有盛誉，是世界高等教育史上具有划时代意义的“威斯康星思想”的发源地，拥有的院士、美国科学委员会学部委员人数以及诺贝尔奖、普利策奖、美国国家科学奖章获得者数量在美国大学中名列前茅。

威斯康星大学麦迪逊分校在各个学科和领域均享有世界级的学术声誉，根据《美国新闻与世界报道》的排名，学校的心理学、教育学、核工程、化学工程、地理、气象、地球科学、市场营销、社会学、药剂学、兽医学等众多专业均位居全美前10，而被评为全美前20是专业更是数不胜数，包括计算机科学、计算机工程、土木工程、机械工程、会计学、公共管理、经济学、历史学等专业，该校的医学院、工程学院、商学院、教育学院、公共事务学院等院都是极具实力的美国顶尖学院。在上海交大世界大学学术排名中，威斯康星大学麦迪逊分校在自然科学领域位居世界第24位，在生命科学领域位居世界第18位，在社会科学领域排名世界第33位，是一所公认的世界级高等学府。

威斯康星大学麦迪逊分校在生物学领域尤其声名卓著，其教授詹姆斯·汤姆森是第一个成功分离胚胎干细胞的科学家，其在数学、化学、统计学、计算机科学以及教育学、经济学、哲学、政治学等学科方面享有盛誉，拥有极强实力和丰厚底蕴，这些学科在2015年U.S.News排行榜上均位列前15名，其社会学更是常年雄踞榜首。根据美国国家科学研究委员会（National Research Council）的研究结果，威斯康星大学麦迪逊分校有20多个学科位列全美前十名。在2013年上海交通大学世界大学学术排名中，威斯康星大学麦迪逊分校名列全球第19名。

威斯康星大学麦迪逊分校是美国大学协会14个创始会员，这14所大学包括：

哥伦比亚大学（常春藤盟校）

康奈尔大学（常春藤盟校）

哈佛大学（常春藤盟校）

普林斯顿大学（常春藤盟校）

宾夕法尼亚大学（常春藤盟校）

耶鲁大学（常春藤盟校）

约翰·霍普金斯大学（东海岸；私立）

斯坦福大学（西海岸；私立）

芝加哥大学（大湖区；私立）

加州大学伯克利分校（西海岸；公立）

密歇根大学安娜堡分校（大湖区；公立）

威斯康星大学麦迪逊分校（大湖区；公立）

克拉克大学（已退出）

美国天主教大学（已退出）